一、办理手续
当被执行人履行完毕债务后，申请人需要按照以下步骤办理相关手续：
1. 提交履行证明
申请人应向执行法院提交被执行人履行债务的证明材料，如银行转账记录、收据、发票等。
2. 填写申请执行结案报告
申请人需填写《申请执行结案报告》，详细说明案件的基本情况、执行过程、被执行人履行债务的情况等。
3. 提交执行结案报告及相关证明材料
将填写好的《申请执行结案报告》及相关证明材料提交给执行法院。
4. 执行法院审查
执行法院对申请人提交的材料进行审查，确认被执行人确实履行了债务。
5. 执行法院出具结案证明
经审查无误后，执行法院出具《执行结案证明》，标志着案件执行完毕。
二、注意事项
1. 及时提交履行证明
被执行人履行债务后，申请人应及时提交履行证明，以免影响案件执行进度。
2. 确保证明材料真实有效
申请人提交的履行证明材料必须真实有效，如有虚假，将承担相应法律责任。
3. 注意履行证明的保存
履行证明是证明案件执行完毕的重要依据，申请人应妥善保存，以备不时之需。
4. 遵循执行法院要求
在办理手续过程中，申请人应遵循执行法院的要求，积极配合执行工作。
5. 注意执行期限
根据《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条规定，执行期限为一年。在执行期限内，申请人应及时办理相关手续，以免超过期限影响自身权益。
三、案例分析
以下是一个实际案例：
案情简介：申请人甲与被执行人乙因合同纠纷诉至法院，法院判决乙支付甲人民币10万元。经执行，乙支付了7万元。甲向法院提交了乙支付的7万元银行转账记录，并填写了《申请执行结案报告》。执行法院审查后，出具了《执行结案证明》。
案例分析：本案中，甲在乙履行部分债务后，及时提交了履行证明，并按照要求办理了相关手续。执行法院在审查后，确认乙履行了债务，并出具了《执行结案证明》。这体现了申请人积极配合执行工作的重要性。
总之，被执行人履行完毕后，申请人应按照规定办理相关手续，并注意相关注意事项，以确保自身权益得到保障。